中等部では学習内容の充実、学力の向上を目指し、6年生から教科担任制をとり、専科教員により授業が行われています。教科担任制をとることにより、早い段階から掘り下げた内容を学習することができ、中学生(7・8・9年生)での学習内容に、よりスムーズに繋げることができます。また、定期考査も実施され、生徒一人ひとりの学習到達度を細かく把握し、指導に活用しています。